Mysen er et tettsted i Indre Østfold kommune i Viken som inntil 2019 var administrasjonssenter i daværende Eidsberg kommune i Østfold.
Mysen har industri, både i tettstedet og ikke minst i Hærland øst for dette, særlig næringsmiddelindustri (meieri, slakteri, mølle, kornsilo), grafisk industri og verkstedindustri. Grustak med betongvareindustri finnes ved Mona, en større sand- og grusavsetning nord for tettstedet.
E18 (Oslo-Ørje-Stockholm) går gjennom nordre del av tettstedet og krysses av riksveg 22 Lillestrøm-Halden. Østfoldbanens østre linje har stasjon i Mysen med endestasjon for lokalforbindelse med Oslo.
I Mysen ligger Heggen og Frøland tingrett og Mysen videregående skole. Like utenfor tettstedet ligger Edwin Ruuds hospital med sykehjem og rehabiliteringsavdeling for Sykehuset Østfold.
Eidsberg bygdemuseum ligger på Folkenborg sørvest for sentrum. Travbane og utstillingsplass finnes på Momarken i nord.
Eidsberg kommune vedtok «bystatus» for Mysen i 1997.
