I söndags vajade flaggorna i Kanada på halvstång och det hölls ett flertal ceremonier för att hedra barnen.
Barnens död har inte tidigare dokumenterats, och nu kräver företrädare för ursprungsbefolkningen en grundlig utredning av det som skett.
Gravarna innehåller kvarlevor av nästan tusen barn från Kanadas ursprungsbefolkning.
Den första chockerande upptäckten gjordes i slutet av maj i British Columbia där 215 barn har begravts. Några av barnen bedöms ha varit bara tre år gamla.
Myndigheterna hade gett den katolska kyrkan i uppdrag att driva Kamloops internatskola i British Columbia. Den var verksam under perioden 1890-1969 och fungerade efter det i statlig regi tills den stängdes 1978.
Några veckor senare hittades kvarlevorna av 715 personer - mestadels barn - i omärkta gravar nära en tidigare katolsk internatskola i Saskatchewan.
Gravarna upptäcktes av speciella maskiner som undersökte terrängen. Det är sannolikt att fler kroppar hittas.
Det här var ett brott mot mänskligheten och ett angrepp på First Nation-folket. Det enda brott vi någonsin begick som barn var att vi var födda inom ursprungsbefolkningen
Bobby Cameron, chef för Ursprungsbefolkningens federation
Båda dessa internatskolor var avsedda för ursprungsbefolkningens barn som med tvång avskiljdes från sina familjer under 1800- och 1900-talet. Skolorna blev obligatoriska på 1920-talet och då kunde föräldrar som vägrade skicka iväg sina barn bli bestraffade med fängelse.
Uppskattningsvis över 4 000 barn – sannolikt betydligt fler – försvann. De nya gravfynden tyder på att många av de här försvunna barnen troligen dog på skolorna.
Enligt BBC uppskattades det år 2015 att cirka 6 000 barn hade dött medan de bodde på skolorna.
Generationer av människor från den kanadensiska ursprungsbefolkningen utsattes för systematisk misshandel på internatskolor. Deras berättelser om misshandel och försvunna barn har dock ofta bemötts med skepsis.
Sjukdomsutbrott var vanliga på skolorna, men det är oklart hur de här barnen dog. Misshandel, nonchalans och olyckor var vanliga företeelser.
Tidigare elever vid skolan har rapporterat om döda småbarn – födda av unga flickor som blivit gravida efter att präster och munkar våldfört sig på dem.
Internatskolor skulle assimilera ursprungsbefolkningen
Enligt det tidigare kanadensiska skolsystemet tvingades urinvånarnas barn att lämna sina familjer och flytta till internatskolor. Det fanns över 130 sådana skolor. År 1996 upphävdes systemet och den sista skolan stängdes.
Uppskattningsvis 150 000 barn från de olika ursprungsfolken tvingades till internatskolorna där de ofta blev illa behandlade. De utsattes också för fysiska och sexuella övergrepp av vuxna. Många av de här barnen återvände aldrig hem.
Barnen fråntogs både sin kultur och sitt modersmål.
Mycket svåra följder för ursprungsbefolkningen
Händelserna i de kanadensiska internatskolorna har satt sin prägel på många människor med kopplingar till ursprungsbefolkningen. Många lider av psykisk ohälsa.
Alkoholism, drogberoende, våld, fattigdom, hemlöshet och höga självmordssiffror är vanligt bland Kanadas ursprungsbefolkning, och det ses som en följd av den här traumatiska behandlingen.
Angela White, som leder IRSSS, en organisation som arbetar till förmån för de som drabbats av internatskolorna, säger att både den federala regeringen och kyrkan nu måste agera mer aktivt, uppger det kanadensiska rundradiobolaget CBC.
– Önskningar och böner är bara en bit på vägen. Försoning betyder ingenting om inte orden kopplas till handlingar.
Sannings- och försoningskommissionen (TRC) uppmanade i en rapport år 2015 den federala regeringen att satsa pengar på center där ursprungsbefolkningen erbjuds vård för sina fysiska, psykiska, emotionella och andliga problem.
Den 4 000 sidor långa rapporten anses vara en milstolpe, och den pekar ut den regeringsledda politiken som kulturellt folkmord. Rapporten pekar på vanvård och bristande trygghet på internatskolorna. Eleverna bodde ofta i illa byggda, ouppvärmda hus med bristande sanitetssystem. Tillgången på hälsovård var bristfällig och straffåtgärder vidtogs regelbundet.
"Påven bör reagera"
IRSSS vill också se en reaktion från påven.
– Vi undrar varför dessa kyrkans lärjungar gjort oss detta. Det går inte längre att förneka de här händelserna. Nu har vi fysiska bevis här i dessa omärkta gravar.
Också i TRC:s rapport uppmanas påven att framföra en ursäkt till de överlevande, deras familjer och samfund på grund av kyrkans roll i misshandeln av First Nations (en benämning i Kanada på ursprungsbefolkning), inuiter och Métis-barn i de katolska internatskolorna.
Känslorna svallar nu i Kanada – katolska kyrkor bränns ned
Fyra katolska kyrkor har förstörts i anlagda bränder de senaste veckorna, och det antas finnas ett samband mellan bränderna och gravfynden.
Många ur Kanadas ursprungsbefolkning tillhör den katolska kyrkan, men församlingsmedlemmar har vittnat om hur illa de blev behandlade i skolorna.
I fredags uppmanade Kanadas premiärminister Justin Trudeau påven Franciskus att be om förlåtelse för övergreppen.
Ursäkt har framförts för "kulturellt folkmord"
År 2008 bad Kanadas regering ursprungsbefolkningen formellt om ursäkt för det som skett med barnen. En del tidigare elever har fått skadestånd av staten.
Den myndighetskommission som utrett händelserna använder sig av termen "kulturellt folkmord" för att beskriva agerandet mot barnen.
Kort efter upptäckten i Saskatchewan förra veckan uppgav premiärminister Justin Trudeau att han hade fört samtal med ledare för ursprungsbefolkningen och lovade att regeringen ska jobba för att gottgöra historiska orättvisor och främja försoning.
En av ledarna Trudeau talade med, Perry Bellegarde, påminde att skadan ingalunda upphör vid 751 offer, utan att den dessutom har påverkat överlevande och deras släktingar.
Källor: CBC, The New York Times, BBC, AP, AFP, Reuters
