Enligt tysk polis inträffade olyckan strax före klockan 17 på måndagseftermiddagen, nära stationen Ebenhausen-Schäftlarn sydväst om München.
Enligt tyska Bild var kring 95 personer ombord på de två tågen.
Passagerare uppger till lokaltidningen Merkur att man hört en högljudd smäll, varefter passagerarna kastades framåt i sina säten på grund av kollisionen.
Trafiken stängdes av på tågsträckan, som är enkelriktad vid olycksplatsen. Kring 200 personer vid räddningstjänsten och polis deltar i räddningsinsatsen.
Det är oklart vad som orsakade olyckan.
Källa: AFP
