Det ena fartyget sjönk efter olyckan som inträffade tidigt på tisdagsmorgonen cirka 22 kilometer sydväst om ön Helgoland utanför den tyska kusten.
Det mindre fartyget Verity var 91 meter långt och seglade under brittisk flagg. Det var på väg från Bremen till den engelska staden Immingham och är det fartyg som har sjunkit. Verity hade sju personer ombord. Två sjömän räddades, och en mans kropp har hitttats medan fyra saknas.
De saknade kan fortfarande vara ombord på det sjunkna fartyget, och dykare söker efter tecken på liv, uppger räddningstjänsten.
Lasten ombord på Verity består av stål och det finns cirka 1 300 kubikmeter diesel ombord, uppger en talesman för det tyska nödtjänstkommandot.
Det Bahamas-flaggade fartyget Polesie, som är 190 meter långt, var på väg från Hamburg till La Coruña i Spanien. Polesie har förblivit flytande och har 22 personer ombord. Alla människor ombord uppges vara oskadade.
En stor räddningsinsats inleddes efter olyckan.
Källor: AFP, Reuters, AP