Proteolyse, nedbrydning af proteiner og peptider til små peptider og aminosyrer ved spaltning (hydrolyse) af peptidbindinger. Nedbrydningen katalyseres i organismen af enzymer, proteaser.

Faktaboks

Etymologi
Ordet proteolyse kommer af protein og græsk lysis 'opløsning'.

Proteolyse i mave-tarm-kanalen er nødvendig for udnyttelse af fødens proteiner. Andre eksempler er aktiveringen af proenzymer og de reaktioner, der indgår i blodkoagulationen. Også den intracellulære proteinnedbrydning og modning af peptidhormoner sker ved proteolyse.