FR2694766A1 - New nucleic acid encoding aminopeptidase PepC of Lactococcus lactis - useful in cheese mfr., also related vectors, transformants, polypeptide(s) etc. - Google Patents

New nucleic acid encoding aminopeptidase PepC of Lactococcus lactis - useful in cheese mfr., also related vectors, transformants, polypeptide(s) etc. Download PDF

Info

Publication number
FR2694766A1
FR2694766A1 FR9210006A FR9210006A FR2694766A1 FR 2694766 A1 FR2694766 A1 FR 2694766A1 FR 9210006 A FR9210006 A FR 9210006A FR 9210006 A FR9210006 A FR 9210006A FR 2694766 A1 FR2694766 A1 FR 2694766A1
Authority
FR
France
Prior art keywords
pepc
aminopeptidase
sequence
nucleic acid
lactococcus lactis
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
FR9210006A
Other languages
French (fr)
Other versions
FR2694766B1 (en
Inventor
Chapot Marie-Pierre
Nardi Michele
Chopin Marie-Christine
Chopin Alain
Gripon Jean-Claude
Monnet Veronique
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institut National de la Recherche Agronomique INRA
Original Assignee
Institut National de la Recherche Agronomique INRA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institut National de la Recherche Agronomique INRA filed Critical Institut National de la Recherche Agronomique INRA
Priority to FR9210006A priority Critical patent/FR2694766B1/en
Publication of FR2694766A1 publication Critical patent/FR2694766A1/en
Application granted granted Critical
Publication of FR2694766B1 publication Critical patent/FR2694766B1/en
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/11Aminopeptidases (3.4.11)
    • C12Y304/11011Aminopeptidase (3.4.11.11)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23CDAIRY PRODUCTS, e.g. MILK, BUTTER OR CHEESE; MILK OR CHEESE SUBSTITUTES; MAKING OR TREATMENT THEREOF
    • A23C19/00Cheese; Cheese preparations; Making thereof
    • A23C19/06Treating cheese curd after whey separation; Products obtained thereby
    • A23C19/063Addition of, or treatment with, enzymes or cell-free extracts of microorganisms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Abstract

Nucleic acid fragment (I) comprising a sequence encoding aminopeptidase PepC (II) of Lactococcus lactis, or a fragment of it, is new. Also claimed are (1) fragments (Ia) of over 10 hp which hybridise specifically with (I) or its complement; (2) recombinant vectors contg. (I) or (Ia); (3) eukaryotic or prokaryotic cells transformed with (I) or (Ia); (4) (II), a polypeptide of 435 amino acids etc. USE/ADVANTAGE - The transformed cells and recombinant proteins are useful in mfr. of foods, esp. cheese. (II) is one of the enzymes involved in cheese maturation, i.e. it generates amino acids (flavour precursors) and decomposes bitter peptides. Transformed cells produce PepC at a higher level than wild type strains.

Description

L'Invention est relative au clonage de séquences d'ADN portant un gène codant pour l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis, à la production de ladite aminopeptidase, et à ses utilisations. The invention relates to the cloning of DNA sequences carrying a gene coding for the PepC aminopeptidase from Lactococcus lactis, to the production of said aminopeptidase, and to its uses.

Les lactocoques utilisés dans l'industrie laitière ont un système protéolytique complexe qui joue un rôle à la fois dans la croissance bactérienne et dans la maturation du fromage. Les acides aminés libres et les petits peptides nécessaires à la croissance bactérienne sont présents dans le lait en quantité relativement faible, et les microorganismes doivent donc hydrolyser les protéines principales du lait, les caséines, afin de pouvoir atteindre une densité cellulaire élevée. The lactococci used in the dairy industry have a complex proteolytic system which plays a role both in bacterial growth and in the ripening of cheese. Free amino acids and small peptides necessary for bacterial growth are present in milk in relatively small quantities, and microorganisms must therefore hydrolyze the main milk proteins, caseins, in order to achieve high cell density.

En outre, les enzymes protéolytiques contribuent à la maturation du fromage en produisant des acides aminés libres qui sont les précurseurs des arômes du fromage, et en dégradant les peptides amers responsables de défauts du fromage. In addition, the proteolytic enzymes contribute to the ripening of the cheese by producing free amino acids which are the precursors of the flavoring of the cheese, and by degrading the bitter peptides responsible for defects in the cheese.

La protéinase extracellulaire associée à l'enveloppe cellulaire [MONNET et al., Appl. Microbiol. The extracellular proteinase associated with the cell envelope [MONNET et al., Appl. Microbiol.

Biotechnol. 31:112-118 (1989)], hydrolyse dans un premier temps la caséine en oligopeptides. La dégradation ultérieure de ces oligopeptides par des peptidases, en combinaison avec l'action de systèmes de transport des peptides et des acides aminés, produit les acides aminés utilisés par les bactéries pour leur biosynthèse.Biotechnol. 31: 112-118 (1989)], first hydrolyzes casein into oligopeptides. The subsequent degradation of these oligopeptides by peptidases, in combination with the action of peptide and amino acid transport systems, produces the amino acids used by bacteria for their biosynthesis.

Une grande variété de peptidases dotées de spécificités différentes ont été mises en évidence dans différentes souches de Lactococcus lactis ; plusieurs enzymes, par exemple des aminopeptidases, des dipeptidases, des tripeptidases aussi bien que des endopeptidases (pour revue voir J. KOK [FEMS Microbiology
Reviews, 87, 15-42 (1990)], ont été purifiées et leurs propriétés biochimiques ont été déterminées.
A large variety of peptidases with different specificities have been demonstrated in different strains of Lactococcus lactis; several enzymes, for example aminopeptidases, dipeptidases, tripeptidases as well as endopeptidases (for review see J. KOK [FEMS Microbiology
Reviews, 87, 15-42 (1990)], have been purified and their biochemical properties have been determined.

En outre, des études génétiques ont été entreprises dans le but d'obtenir plus d'informations concernant la structure, la localisation et l'expression de ces enzymes, afin d'élucider la contribution de chacune d'entre elles dans le processus de dégradation des caséines. Le clonage desdits gènes a également été entrepris, dans le but, par exemple de pouvoir augmenter l'expression d'une enzyme en insérant plusieurs copies du gène correspondant dans une même bactérie, ou de pouvoir les transférer dans une autre souche bactérienne utilisée dans l'industrie laitière, ou de pouvoir produire les enzymes correspondantes par génie génétique. In addition, genetic studies have been undertaken with the aim of obtaining more information concerning the structure, localization and expression of these enzymes, in order to elucidate the contribution of each of them in the degradation process. caseins. The cloning of said genes has also been undertaken, with the aim, for example, of being able to increase the expression of an enzyme by inserting several copies of the corresponding gene in the same bacterium, or of being able to transfer them to another bacterial strain used in the dairy industry, or to be able to produce the corresponding enzymes by genetic engineering.

Le gène pepXP codant pour une X-prolyldipeptidyl-aminopeptidase a été caractérisé le premier [NARDI et al., Appl. Environ. Microbio., 57, 45-50, (1991) ; MAYO et al., Appl. Environ. Microbiol., 57, 3844, (1991)]
Plus récemment, le gène pepN qui code pour une métallo-aminopeptidase dénommée PepN (ou également AP II) a été cloné, VAN ALEN-BOERRIGTER et al [Appl. Environ.
The pepXP gene coding for an X-prolyldipeptidyl-aminopeptidase was first characterized [NARDI et al., Appl. About. Microbio., 57, 45-50, (1991); MAYO et al., Appl. About. Microbiol., 57, 3844, (1991)]
More recently, the pepN gene which codes for a metallo-aminopeptidase called PepN (or also AP II) has been cloned, VAN ALEN-BOERRIGTER et al [Appl. About.

Microbiol. 57:2555-2561 (1991)]. L'aminopeptidase AP II avait été caractérisée et purifiée auparavant par TAN et
KONINGS, [Appl. Environ. Microbiol., 56:526-532 (1990)]
Une autre aminopeptidase, dénommée PepC (ou également AP I), et possédant également une large spécificité de substrats, a été purifiée à partir de
Lactococcus. lactis subsp cremoris AM2, et son existence chez d'autres lactocoques a été démontréé [NEVIANI et al., Appl. Environ. Microbiol., 55:2308-2314 (1989)
Demande PCT WO/91 03738, au nom de 1'INSTITUT NATIONAL DE
LA RECHERCHE AGRONOMIQUE ; BOQUIEN et al., Appl Environ.
Microbiol. 57: 2555-2561 (1991)]. Aminopeptidase AP II had previously been characterized and purified by TAN and
KONINGS, [Appl. About. Microbiol., 56: 526-532 (1990)]
Another aminopeptidase, called PepC (or also AP I), and also having a broad specificity of substrates, was purified from
Lactococcus. lactis subsp cremoris AM2, and its existence in other lactococci has been demonstrated [NEVIANI et al., Appl. About. Microbiol., 55: 2308-2314 (1989)
PCT application WO / 91 03738, on behalf of the NATIONAL INSTITUTE OF
AGRONOMIC RESEARCH; BOQUIEN et al., Appl Environ.

Microbiol., 57, 2211-2216, (1991)].Microbiol., 57, 2211-2216, (1991)].

Des études biochimiques et immunochimiques ont montré que 1'aminopeptidase PepC est clairement différente de l'aminopeptidase PepN. L'aminopeptidase
PepC hydrolyse des acides aminés substitués par le naphtylamide, aussi bien que des di- et des tripeptides.
Biochemical and immunochemical studies have shown that PepC aminopeptidase is clearly different from PepN aminopeptidase. Aminopeptidase
PepC hydrolyzes amino acids substituted by naphthylamide, as well as di- and tripeptides.

I1 s'agit d'un hexamère de 300 kDa composé de sous unités identiques, et son activité enzymatique est inhibée par les composés qui bloquent les groupes thiol, mais pas par les inhibiteurs classiques des sérines protéases et des métallo-protéases.  It is a 300 kDa hexamer composed of identical subunits, and its enzymatic activity is inhibited by the compounds which block the thiol groups, but not by the conventional inhibitors of serine proteases and metallo-proteases.

Les Inventeurs ont maintenant entrepris de cloner et de séquencer le gène codant pour l'aminopeptidase PepC des lactocoques. The inventors have now undertaken to clone and sequence the gene coding for the PepC aminopeptidase of lactococci.

Le gène codant pour l'aminopeptidase PepC de
Lactococcus lactis subsp. cremoris AM2 a été cloné par complémentation d'un mutant pepN de Escherîchia col i, lequel mutant est dépourvu d'activité aminopeptidase.
The gene encoding the PepC aminopeptidase from
Lactococcus lactis subsp. cremoris AM2 was cloned by complementation of a pepN mutant from Escherichia col i, which mutant lacks aminopeptidase activity.

Une banque d'ADN de la souche AM2 a été construite dans le mutant de E. coli en utilisant le plasmide Bluescript, et été criblée à l'aide d'un essai enzymatique sur boîte en utilisant la Leu--naphtylamide comme substrat. Un clone exprimant l'activité aminopeptidase PepC a été sélectionné par immunoblotting en utilisant des anticorps polyclonaux dirigés contre l'enzyme purifiée. Le gène codant pour l'aminopeptidase
PepC, dénommé pepC, a été sous-cloné et séquencé. I1 code pour une protéine de 435 acides aminés. I1 apparaît qu'il ne possède pas de séquence signal, ce qui suggère une localisation intracellulaire de l'enzyme.L'analyse de la séquence d'acides aminés déduite de la séquence nucléotidique de pepC montre une homologie importante avec le site actif des protéases à cystéine, et en particulier une conservation des acides aminés impliqués dans le site catalytique.
A DNA library of the AM2 strain was constructed in the E. coli mutant using the plasmid Bluescript, and was screened using an enzymatic box assay using Leu-naphthylamide as substrate. A clone expressing PepC aminopeptidase activity was selected by immunoblotting using polyclonal antibodies directed against the purified enzyme. The gene coding for aminopeptidase
PepC, called pepC, has been subcloned and sequenced. It codes for a protein of 435 amino acids. It appears that it does not have a signal sequence, which suggests an intracellular localization of the enzyme. Analysis of the amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence of pepC shows significant homology with the active site of the proteases to cysteine, and in particular a conservation of the amino acids involved in the catalytic site.

La présente invention a pour objet un fragment d'acide nucléique, caractérisé en ce qu'il comprend une séquence codant pour l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis, ou pour un fragment de celle-ci. The subject of the present invention is a nucleic acid fragment, characterized in that it comprises a sequence coding for the aminopeptidase PepC of Lactococcus lactis, or for a fragment thereof.

La séquence d'un fragment d'acide nucléique conforme à l'Invention est représentée dans la liste des séquences en annexe sous le n SEQ. ID. N 1. La séquence codant pour l'aminopeptidase PepC (cadre de lecture ORF1) correspond aux bases 718 à 2025 de ladite séquence. La séquence polypeptidique de l'aminopeptidase PepC déduite du cadre de lecture ORF1 est également représentée. The sequence of a nucleic acid fragment in accordance with the invention is represented in the list of sequences in the appendix under the n SEQ. ID. N 1. The sequence coding for the aminopeptidase PepC (reading frame ORF1) corresponds to bases 718 to 2025 of said sequence. The polypeptide sequence of the aminopeptidase PepC deduced from the ORF1 reading frame is also shown.

I1 doit être bien entendu que l'invention englobe également tous les fragments d'ADN dont la séquence est dérivée de la séquence SEQ. ID. N 1, et en particulier des fragments d'acide nucléique de plus de 10 pb s'hybridant spécifiquement avec ladite séquence, ou avec son complémentaire, ainsi que toutes les séquences qui, du fait de la dégénérescence du code génétique, codent pour l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis ou d'une espèce de lactocoque voisine, ainsi que pour ses isoformes ou variants alléliques, ou pour un fragment de ces protéines. De telles séquences peuvent par exemple, être obtenues à partir de la séquence SEQ. ID. N 1 par mutagenèse dirigée. It should be understood that the invention also encompasses all DNA fragments whose sequence is derived from the sequence SEQ. ID. N 1, and in particular nucleic acid fragments of more than 10 bp which hybridize specifically with said sequence, or with its complement, as well as all the sequences which, due to the degeneration of the genetic code, code for the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis or from a neighboring lactococcus species, as well as for its isoforms or allelic variants, or for a fragment of these proteins. Such sequences can, for example, be obtained from the sequence SEQ. ID. N 1 by site-directed mutagenesis.

L'Invention a également pour objet des vecteurs recombinants (plasmides, virus, etc...) caractérisés en ce qu'ils comprennent au moins un segment d'ADN tel que défini ci-dessus, codant pour l'aminopeptidase
PepC de Lactococcus lactis, ou pour un fragment de celle-ci.
The invention also relates to recombinant vectors (plasmids, viruses, etc.) characterized in that they comprise at least one DNA segment as defined above, coding for the aminopeptidase
PepC from Lactococcus lactis, or a fragment thereof.

Un vecteur recombinant conforme à l'Invention a été déposé en date du 12 août 1992, sous le numéro de dépôt I-1258, auprès de la Collection Nationale de
Cultures de Microorganismes (C.N.C.M.), tenue par 1'INSTITUT PASTEUR, 25, rue du Docteur Roux, 75724 PARIS
CEDEX 15.
A recombinant vector conforming to the invention was deposited on August 12, 1992, under the deposit number I-1258, with the National Collection of
Cultures of Microorganisms (CNCM), held by INSTITUT PASTEUR, 25, rue du Docteur Roux, 75724 PARIS
CEDEX 15.

Selon un mode de réalisation préféré de la présente Invention, lesdits vecteurs sont des vecteurs d'expression, comprenant des séquences propres à contrôler l'expression du gène pepC (promoteur, terminateur, etc...). According to a preferred embodiment of the present invention, said vectors are expression vectors, comprising sequences suitable for controlling the expression of the pepC gene (promoter, terminator, etc.).

La présente Invention a également pour objet des cellules eucaryotes ou procaryotes transformées (et en particulier des microorganismes), caractérisées en ce qu'elles contiennent au moins un fragment d'acide nucléique tel que défini ci-dessus, et en particulier les cellules comprenant au moins un exemplaire du gène codant pour l'aminopeptidase PepC . Ce gène peut être porté par un vecteur recombinant conforme à l'Invention, ou bien intégré dans 1ADN chromosomique de la cellule hôte. The present invention also relates to transformed eukaryotic or prokaryotic cells (and in particular microorganisms), characterized in that they contain at least one nucleic acid fragment as defined above, and in particular the cells comprising at minus one copy of the gene coding for the aminopeptidase PepC. This gene can be carried by a recombinant vector in accordance with the invention, or else integrated into the chromosomal DNA of the host cell.

L'Invention a également pour objet un polypeptide de 435 acides aminés dont la séquence est celle de 1'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis, et plus particulièrement celle de l'aminopeptidase PepC de
Lactococcus lactis subsp. cremoris AM2, codée par le cadre de lecture de la séquence nucléotidique représentée à la liste des séquences, sous le numéro SEQ. ID. N 1.
The subject of the invention is also a polypeptide of 435 amino acids whose sequence is that of the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis, and more particularly that of the aminopeptidase PepC from
Lactococcus lactis subsp. cremoris AM2, coded by the reading frame of the nucleotide sequence represented in the list of sequences, under the number SEQ. ID. N 1.

L'Invention englobe, bien entendu, les polypeptides dont la séquence ne diffère de la séquence mentionnée ci-dessus que par quelques acides aminés, en particulier des polypeptides représentant des variants alléliques ou des isoformes de l'aminopeptidase PepC de
Lactococcus lactis.
The invention encompasses, of course, the polypeptides whose sequence differs from the sequence mentioned above only by a few amino acids, in particular polypeptides representing allelic variants or isoforms of the aminopeptidase PepC of
Lactococcus lactis.

L'Invention comprend également tout fragment peptidique dont la séquence représente plus de 5 acides aminés consécutifs de celle de l'aminopeptidase PepC de
Lactococcus lactis ; un tel fragment est avantageusement un polypeptide portant un épitope spécifique de ladite aminopeptidase
L'Invention comprend également des préparations d'aminopeptidase PepC obtenues par génie génétique, ainsi que de manière plus générale, des préparations de protéines recombinantes comprenant tout ou partie de la séquence de l'aminopeptîdase PepC, éventuellement fusionnée avec une autre séquence peptidique.
The invention also includes any peptide fragment whose sequence represents more than 5 consecutive amino acids of that of the aminopeptidase PepC of
Lactococcus lactis; such a fragment is advantageously a polypeptide carrying an epitope specific for said aminopeptidase
The invention also includes preparations of aminopeptidase PepC obtained by genetic engineering, as well as more generally, preparations of recombinant proteins comprising all or part of the sequence of the aminopeptidase PepC, optionally fused with another peptide sequence.

L'Invention concerne également un procédé de production de l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis, ou d'une protéine recombinante telle que définie ci-dessus, lequel procédé est caractérisé en ce qu'il comprend une étape au cours de laquelle l'on procède à la mise en culture de cellules transformées telles que définies plus haut, comprenant au moins un fragment d'ADN conforme à l'Invention. The invention also relates to a process for producing the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis, or a recombinant protein as defined above, which process is characterized in that it comprises a step during which proceeds to culture transformed cells as defined above, comprising at least one DNA fragment in accordance with the invention.

Les cellules transformées, ainsi que les préparations d'aminopeptidase PepC obtenues par génie génétique conformément à l'Invention, sont utilisables dans l'industrie agro-alimentaire pour la fabrication d'aliments, en particulier de fromages. The transformed cells, as well as the PepC aminopeptidase preparations obtained by genetic engineering in accordance with the invention, can be used in the food industry for the manufacture of food, in particular cheese.

La présente Invention sera mieux comprise à l'aide du complément de Description qui va suivre, qui se réfère au clonage et à l'expression du gène pepC de
Lactococcus lactis, cloné à partir de Lactococcus lactis ssp creinoris AM2. I1 va de soi toutefois que ces exemples sont donnés uniquement à titre d'illustration de l'objet de l'Invention dont ils ne constituent en aucune manière une limitation.
The present invention will be better understood with the aid of the additional description which follows, which refers to the cloning and expression of the pepC gene of
Lactococcus lactis, cloned from Lactococcus lactis ssp creinoris AM2. It goes without saying, however, that these examples are given solely by way of illustration of the subject of the invention, of which they in no way constitute a limitation.

EXEMPLE 1 : CLONAGE DU GENE DE L'AMINOPEPTIDASE PepC
Le gène de 1'aminopeptidase de L. lactis subsp. cremoris AM2 a été cloné par complémentation de la mutation pepN de E. coli 1047.
EXAMPLE 1: CLONING OF THE AMINOPEPTIDASE PepC GENE
The aminopeptidase gene of L. lactis subsp. cremoris AM2 was cloned by complementation of the E. coli 1047 pepN mutation.

l)Souches bactériennes, plasmides, et milieux de culture
L. lactis subsp. cremoris AM2 a été obtenu à partir de la collection de cultures du Centre de
Recherches de JOUY-EN-JOSAS. La souche E. coli 1047 (met, supE, supF, hsdS, recA, pepN) est celle décrite par LATIL et al. [Molec. Gen. Genet. 148:43-47 (1976)] ; ce mutant est incapable d'hydrolyser le Leu-ssNA.
l) Bacterial strains, plasmids, and culture media
L. lactis subsp. cremoris AM2 was obtained from the Center's culture collection
Research by JOUY-EN-JOSAS. The E. coli 1047 strain (met, supE, supF, hsdS, recA, pepN) is that described by LATIL et al. [Molec. Gen. Broom. 148: 43-47 (1976)]; this mutant is unable to hydrolyze Leu-ssNA.

L. lactis subsp. cremoris a été cultivé, à 30oC, sur milieu M17 [TERZAGHI et al. Appl. Microbiol. L. lactis subsp. cremoris was cultivated, at 30oC, on M17 medium [TERZAGHI et al. Appl. Microbiol.

Rev. 46:245-268 (1975)], dans lequel le lactose a été remplacé par le glucose . E. coli a été cultivé sur milieu de LURIA-BERTANI [MANIATIS et al., Molecular
Cloning : A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, (1982)], à 37 C.
Rev. 46: 245-268 (1975)], in which lactose has been replaced by glucose. E. coli was cultivated on LURIA-BERTANI medium [MANIATIS et al., Molecular
Cloning: A Laboratory Manual. Cold spring harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, (1982)], at 37 C.

L'ampicilline (Ap) a été ajoutée, lorsque nécessaire, à une concentration finale de 50 Rg/ml au milieu de culture. Le plasmide pBluescript a été obtenu auprès de
STRATAGENE (La Jolla, Calif.).
Ampicillin (Ap) was added, when necessary, to a final concentration of 50 Rg / ml in the culture medium. The plasmid pBluescript was obtained from
STRATAGENE (La Jolla, Calif.).

2) Clonage moléculaire
Une banque d'ADN total de L. lactis subsp.
2) Molecular cloning
A total DNA library of L. lactis subsp.

cremoris AM2 a été construite dans la souche mutante de
E. coli 1047, en utilisant le plasmide pBluescript.
cremoris AM2 was built in the mutant strain of
E. coli 1047, using the plasmid pBluescript.

L'ADN de Lactococcus lactis a été préparé selon le protocole décrit par LOUREIRO DOS SANTOS, et A. The Lactococcus lactis DNA was prepared according to the protocol described by LOUREIRO DOS SANTOS, and A.

CHOPIN [FEMS Microbiol. Lett. 42:209-212 (1982)]. Les endonucléases de restriction et la ligase T4 ont été obtenus auprès de BOEHRINGER MANNKEIM BIOCHEMICALS, et utilisées selon les instructions du fabricant. Les protocoles de manipulation de l'ADN, de transformation des cellules E. coli, et de clonage sont ceux décrits par
MANIATIS et al. (référence précitée).
CHOPIN [FEMS Microbiol. Lett. 42: 209-212 (1982)]. Restriction endonucleases and T4 ligase were obtained from BOEHRINGER MANNKEIM BIOCHEMICALS, and used according to the manufacturer's instructions. DNA manipulation, E. coli cell transformation, and cloning protocols are those described by
MANIATIS et al. (reference cited above).

L'ADN total de la souche AM2 a été digéré partiellement par l'endonucléase Sau3A de manière à obtenir des fragments de taille moyenne 5 kb. Ces fragments ont été ligaturés dans le plasmide pBluescript préalablement digéré par l'endonucléase BamHI et déphosphorylé. Le produit de ligation a été utlisé pour transformer des cellules compétentes E. coli 1047.Les cellules transformées résistantes à l'ampicilline ont été sélectionnées en procédant à la recherche de l'activité aminopeptidase par essai enzymatique sur plaque, dans les conditions suivantes
- La recherche de l'activité aminopeptidase a été faite en utilisant la Leu-Bnaphtylamide (Leu-ssNA) (Sigma) comme substrat. 0,2 ml de solution de L-Leu-ssNA (10 mg/ml dans du méthanol) ont été mélangés avec 5 ml de tampon phosphate (pH 7) et 1 ml de Fast Garnet GBC (SIGMA, St. Louis) (10 mg/ml dans l'eau). Le mélange est versé sur des boîtes de culture portant les bactéries transformées. Après quelques minutes d'incubation à température ambiante, les clones positifs apparaissent colorés en rouge.
The total DNA of the AM2 strain was partially digested with the Sau3A endonuclease so as to obtain fragments of average size 5 kb. These fragments were ligated into the pBluescript plasmid previously digested with the BamHI endonuclease and dephosphorylated. The ligation product was used to transform competent E. coli 1047 cells. The transformed ampicillin-resistant cells were selected by carrying out an assay for aminopeptidase activity by enzymatic plaque assay, under the following conditions
- The search for aminopeptidase activity was made using Leu-Bnaphthylamide (Leu-ssNA) (Sigma) as a substrate. 0.2 ml of L-Leu-ssNA solution (10 mg / ml in methanol) was mixed with 5 ml of phosphate buffer (pH 7) and 1 ml of Fast Garnet GBC (SIGMA, St. Louis) (10 mg / ml in water). The mixture is poured onto culture dishes carrying the transformed bacteria. After a few minutes of incubation at room temperature, the positive clones appear colored red.

Le criblage de la banque par cette méthode a permis d'obtenir deux clones positifs à partir de 3000 transformants résistant à l'ampicilline. Screening the library by this method made it possible to obtain two positive clones from 3000 ampicillin-resistant transformants.

Les deux clones obtenus ont ensuite été caractérisés par immunoblotting, selon la procédure suivante
Un lysat de chacun des 2 clones sélectionnés a été préparé comme suit
Les bactéries sont cultivées pendant une nuit dans du milieu LB contenant de l'ampicilline à 50 Fg/ml. Des aliquots d'un ml de culture sont prélevés et centrifugés et le culot bactérien est lavé une fois dans 1 ml de tampon Tri-HCl 200 mM pH 8, et resuspendu dans 25 l de H2O.Le même volume de tampon de dénatiration (Tris 62,5 mM, SDS 2,5%, ss-mercaptoéthanol 5%, glycérol 10%, bleu de bromophénol 0,01%) concentré deux fois a été ajouté et les échantillons sont chauffés à 100 C pendant 5 minutes. 10 1 du mélange sont déposés sur un gel de polyacrylamide et l'on procède à l'électrophorèse en présence de SDS.
The two clones obtained were then characterized by immunoblotting, according to the following procedure
A lysate of each of the 2 selected clones was prepared as follows
The bacteria are grown overnight in LB medium containing ampicillin at 50 Fg / ml. One ml aliquots of culture are removed and centrifuged and the bacterial pellet is washed once in 1 ml of 200 mM Tri-HCl buffer pH 8, and resuspended in 25 l of H2O. The same volume of denaturation buffer (Tris 62.5 mM, 2.5% SDS, 5% ss-mercaptoethanol, 10% glycerol, 0.01% bromophenol blue) concentrated twice was added and the samples are heated at 100 ° C for 5 minutes. 10 l of the mixture are deposited on a polyacrylamide gel and electrophoresis is carried out in the presence of SDS.

Après électrophorèse, les protéines sont transférées sur des membranes de nitrocellulose en utilisant une cellule TRANS BLOT (Biorad), pendant 1 heure à 100 volts dans du tampon Tris-HCL 25 mM, 192 mM de glycine pH 8,3 et 20% de méthanol. La saturation de la nitrocellulose et les incubations et lavages ultérieurs sont effectués dans un tampon phosphate 10 mM pH 7,4, 150 mM NaCl, 1% de poudre de lait écrémé et 0,05% de
Tween X100. Des sérums de lapin anti-PepC (1/500), anti-PepN (1/1000), ainsi que des anticorps de chèvre anti-lapin couplés à la peroxydase (dilution 1/1000) (INSTITUT PASTEUR) ont été successivement mis à incuber avec la membrane de nitrocellulose pendant 1 heure à température ambiante. Le 4-chloro-l-naphtol a été utilisé comme substrat pour la peroxydase.
After electrophoresis, the proteins are transferred to nitrocellulose membranes using a TRANS BLOT cell (Biorad), for 1 hour at 100 volts in 25 mM Tris-HCL buffer, 192 mM glycine pH 8.3 and 20% methanol. . The saturation of the nitrocellulose and the subsequent incubations and washes are carried out in a 10 mM phosphate buffer pH 7.4, 150 mM NaCl, 1% of skimmed milk powder and 0.05% of
Tween X100. Anti-PepC (1/500), anti-PepN (1/1000) rabbit sera, as well as anti-rabbit goat antibodies coupled with peroxidase (dilution 1/1000) (INSTITUT PASTEUR) were successively brought to incubate with the nitrocellulose membrane for 1 hour at room temperature. 4-chloro-1-naphthol was used as the substrate for peroxidase.

Les résultats sont illustrés par la figure 1. The results are illustrated in Figure 1.

Dans la figure 1A la révélation est faite à l'aide d'anticorps anti-PepC, la figure IB correspond à la révélation à l'aide d'anticorps anti-PepN. Dans les deux cas, la piste 1 représente un extrait protéique du mutant pepN de E. coli, la piste 2, le clone positif n 1, la piste 3, le clone positif n 2, la piste 4, un extrait cytoplasmique de L. lactis subsp. cremoris AM2.In FIG. 1A, the revelation is made using anti-PepC antibodies, FIG. 1B corresponds to the revelation using anti-PepN antibodies. In both cases, lane 1 represents a protein extract of the E. coli pepN mutant, lane 2, the positive clone n 1, lane 3, the positive clone n 2, lane 4, a cytoplasmic extract of L. lactis subsp. cremoris AM2.

Les anticorps anti-PepC et anti-PepN reconnaissent respectivement le monomère de 50 kDa de l'aminopeptidase PepC, et l'aminopeptidase PepN dans l'extrait cytoplasmique total de AM2 (piste 4). Aucune bande protéique n'est détectée par l'anticorps anti-PepC dans le lysat du mutant pepN de E. coli (1A piste 1), alors que la bande de 55 kDa qui apparaît lorsque le même lysat est révélé par l'anticorps anti-PepN (figure 1B piste 1) apparaît comme n'étant pas spécifique. The anti-PepC and anti-PepN antibodies recognize respectively the 50 kDa monomer of the aminopeptidase PepC, and the aminopeptidase PepN in the total cytoplasmic extract of AM2 (lane 4). No protein band is detected by the anti-PepC antibody in the lysate of the E. coli pepN mutant (1A lane 1), whereas the 55 kDa band which appears when the same lysate is revealed by the anti -PepN (Figure 1B track 1) appears not to be specific.

Les anticorps dirigés contre PepC reconnaissent une protéine de 50 kDa dans le lysat cellulaire du clone 1 (figure 1A, piste 2) cette bande correspond bien au poids moléculaire du monomère de PepC révélé dans l'extrait cytosolique de AM2 (figure 1A, piste 4). Aucune bande n'est en revanche détectée lorsque le lysat du clone 2 est révélé par l'anticorps anti-PepC (figure 1A, piste 3). En revanche, l'utilisation d'anticorps anti-PepN montre que le clone 2 exprime l'aminopeptidase PepN (figure 1B, piste 3). The antibodies directed against PepC recognize a 50 kDa protein in the cell lysate of clone 1 (FIG. 1A, lane 2) this band corresponds well to the molecular weight of the PepC monomer revealed in the cytosolic extract of AM2 (FIG. 1A, lane 4 ). No band is however detected when the lysate of clone 2 is revealed by the anti-PepC antibody (FIG. 1A, lane 3). On the other hand, the use of anti-PepN antibodies shows that clone 2 expresses the PepN aminopeptidase (FIG. 1B, lane 3).

Le plasmide recombinant obtenu à partir du clone 1 a été dénommé pTIL4. Ce plasmide porte un insert d'ADN de 15 kb. A partir de ce plasmide, un fragment
PvuII de 2,7 kb portant le gène de l'aminopeptîdase PepC a été sous cloné. Le plasmide portant ce fragment a été dénommé pTIL24, ce plasmide a été déposé à la Collection
Nationale de Cultures de Microorganismes (C.N.C.M.) tenue par 1'INSTITUT PASTEUR, 25, rue du Docteur ROUX, 75724
PARIS CEDEX 15, en date du 12 août 1992 sous le numéro de dépôt I-1258.
The recombinant plasmid obtained from clone 1 was designated pTIL4. This plasmid carries a 15 kb DNA insert. From this plasmid, a fragment
2.7 kb PvuII carrying the PepC aminopeptidase gene was subcloned. The plasmid carrying this fragment was designated pTIL24, this plasmid was deposited in the Collection
Nationale de Cultures de Microorganismes (CNCM) run by INSTITUT PASTEUR, 25, rue du Docteur ROUX, 75724
PARIS CEDEX 15, dated August 12, 1992 under deposit number I-1258.

La séquence nucléotidique de l'insert d'ADN de 2664 pb du plasmide pTIL24 a été déterminée, par deux techniques différentes : d'une part sur 1'ADN simple brin [NARDI et al., Appl. Environ. Microbiol., 57, 45-50, (1991)], et d'autre part sur ADN double brin, en utilisant le kit de séquençage PROMEGA CYCLE, en suivant le protocole préconisé par le fabricant. The nucleotide sequence of the 2664 bp DNA insert of the plasmid pTIL24 was determined by two different techniques: on the one hand on single-stranded DNA [NARDI et al., Appl. About. Microbiol., 57, 45-50, (1991)], and on the other hand on double stranded DNA, using the PROMEGA CYCLE sequencing kit, following the protocol recommended by the manufacturer.

Cette séquence est représentée sur la liste des séquences en annexe sous le numéro SEQ ID NO 1 : elle contient un premier cadre de lecture (ORF1) de 436 codons, et la partie C-terminale d'un autre cadre ouvert de lecture (ORF2), de même orientation. This sequence is represented on the list of sequences in the appendix under the number SEQ ID NO 1: it contains a first reading frame (ORF1) of 436 codons, and the C-terminal part of another open reading frame (ORF2) , with the same orientation.

La longueur de ORF1 correspond à celle d'un cadre de lecture codant pour une protéine de 50 kDa. Un site potentiel de liaison au ribosomes (RBS) complémentaire de l'extrémité 3' du RNA ribosomal 16S de
L. lactis subsp. lactis, a été trouvé 4 pb en amont du codon d'initiation AUG. Des régions comportant les séquences consensus des promoteurs -10 et -35 de lactocoque ont été localisées aux positions 581 et 614 de la séquence nucléotidique. Un terminateur potentiel de transcription a été mis en évidence, 14 pb en aval du codon stop de ORF1.
The length of ORF1 corresponds to that of a reading frame coding for a protein of 50 kDa. A potential ribosome binding site (RBS) complementary to the 3 'end of the 16S ribosomal RNA of
L. lactis subsp. lactis, was found 4 bp upstream of the initiation codon AUG. Regions comprising the consensus sequences of the lactococcus promoters -10 and -35 were located at positions 581 and 614 of the nucleotide sequence. A potential transcription terminator has been identified, 14 bp downstream of the stop codon of ORF1.

Afin de vérifier que ORF1 codait bien pour l'aminopeptidase PepC, la séquence d'acides aminés
N-terminale de 1'aminopeptidase PepC purifiée a été déterminée. Cette séquence : Thr-Val-Thr-Ser-Asp-Phe-Thr Gln-Lys-Leu-Tyr-Glu-Asn-Phe-Ala-, concorde avec celle qui est déduite des codons 2 à 16 du cadre de lecture ORF1.
In order to verify that ORF1 coded well for the aminopeptidase PepC, the amino acid sequence
N-terminal purified PepC aminopeptidase was determined. This sequence: Thr-Val-Thr-Ser-Asp-Phe-Thr Gln-Lys-Leu-Tyr-Glu-Asn-Phe-Ala-, agrees with that which is deduced from codons 2 to 16 of the reading frame ORF1.

Ceci confirme que l'aminopeptidase PepC est codée par
ORF1 et démontre que la protéine subit un clivage de la méthionine N-terminale. D'autre part, aucune séquence hydrophobe correspondant à un éventuel peptide signal n'a été localisée.
This confirms that the PepC aminopeptidase is encoded by
ORF1 and demonstrates that the protein undergoes cleavage of the N-terminal methionine. On the other hand, no hydrophobic sequence corresponding to a possible signal peptide has been located.

EXEMPLE 2 : SUREXPRESSION DU GENE DE L'AMINOPEPTIDASE
PepC CLONE DANS UN VECTEUR MULTICOPIE
Le fragment d'ADN cloné de 2,7 kb qui porte le gène pepC et ses propres signaux d'expression a été cloné dans le site XhoI du vecteur multicopie pIL253. Ce vecteur est présent à un nombre de copies de 50 à 60 par bactérie [SIMON et CHOPIN, Biochimie, 70, 559-566 (1988)]
Le plasmide recombinant a été introduit par électroporation dans la souche SL5117 de L. lactis subsp.
EXAMPLE 2 OVEREXPRESSION OF THE AMINOPEPTIDASE GENE
PepC CLONE IN A MULTICOPIC VECTOR
The cloned 2.7 kb DNA fragment which carries the pepC gene and its own expression signals was cloned into the XhoI site of the multicopy vector pIL253. This vector is present in a copy number of 50 to 60 per bacterium [SIMON and CHOPIN, Biochemistry, 70, 559-566 (1988)]
The recombinant plasmid was introduced by electroporation into the SL5117 strain of L. lactis subsp.

lactis. Cette souche a été obtenue par mutagénèse à la nitrosoguanidine de la souche MQ422 [KIWAKI et al. MOL.lactis. This strain was obtained by mutagenesis with nitrosoguanidine of the strain MQ422 [KIWAKI et al. MOL.

MICROBIOL. 3, 359-369, (1989)], qui est elle-même dérivée de la souche NCDO763 après curage de ses plasmides. La souche SL5117 est partiellement dépourvue d'activité aminopeptidase et les expériences d'immunoblotting montrent qu'elle n'exprime plus l'enzyme PepN alors que l'expression de PepC n'est pas affectée.MICROBIOL. 3, 359-369, (1989)], which is itself derived from the strain NCDO763 after cleaning its plasmids. The SL5117 strain is partially devoid of aminopeptidase activity and the immunoblotting experiments show that it no longer expresses the enzyme PepN while the expression of PepC is not affected.

Les clones transformés par le plasmide pIL253 ont été sélectionnés pour leur résistance à l'érythromycine. Les dosages d'activité effectués avec le substrat Met-pNA sur l'un des clones sélectionnés après lyse des bactéries révèlent une activité PepC 25 fois plus élevée dans la souche transformée que dans la souche
SL5117 sans plasmide.
The clones transformed by the plasmid pIL253 were selected for their resistance to erythromycin. The activity assays carried out with the Met-pNA substrate on one of the clones selected after lysis of the bacteria reveal a PepC activity 25 times higher in the transformed strain than in the strain
SL5117 without plasmid.

LISTE DES SEQUENCES : SEQ. ID. N01 CAGCTGAACAACTGGTAATTGATTATTCAGAGAAAAGTGTGATAGTTCAAAAAGAAAAATTAATTGCAAAAAATACTGACGAAAATTTGAAGCTAATTTTTACTGATGGAGTGCAACAAA 120
A E Q L V I D I S E K S V I V Q K E K L I A K N T D N N L K L I F T D G V Q Q
ORF#
AAGAGATTAACCAGTTTATCAGTAAGAGTCAAGCTTTTGTTGCTGGACTTATGCATGATATTGGTGGGGTTTATCCAAATCATCAGCGAGTAGAAAAAGCAGAATTATTTGGTATAGAAT 240
K E I N Q F I S K S Q A F V A G L N H D I G G V I P N E Q R V E K A L E F G I E
TACTGACAGAAGAGCGTGAATTTCCTTTGATTATTCATCAAAAACTTTCTAAATATCTGGCGCGTGAGCATTTTAAAATTACTGACGAAAATATATTGTCAGCGATTGAGTGCCACACAA 480
T L K E N F T E L D L I V F L A D K I S W D G G D N A P F K E G L L T A L S V N
TGCAAAGTGCAGCACTTTATTATATAGACTTCATCATCAATGATGGCTTGAAAGTTGCGCACCCGTGGCTTTTAGAAGCAAAGAAAGATTTAGAAAATCAGCTTTCCTAGCTGATTTTTT 600
L Q S A A L Y Y I D F I I N D G L K V A H P W L L E A K K D L E N Q L S *
-35
TGATAATTTAGATTATAATAGAAGAATGTAAAAATAATAGAATATCATTAATCAAAATCGATAATGATTATTTTTATCGAAACTTTTGTCAGAAGTTTCGATTTATTGGGAGGTATTATG 720
RES M 1
-10 ORF1#
ACAGTAACATCAGATTTCACACAAAAACTCTACGAAAATTTTGCTGAAAACACAAAATTGCGTGCGGTGGAAAATGCCGTGACTAAAAATGGTTTGCTTTCATCACTCGAAGTGCGTGGT 840
T V T S D F T Q E L T E N F A E N T K L R A V E N A V T E N G L L S S L S V R G 41
TCACATGCAGCGAATTTGCCTGAGTTTTCACTTGACTTGACAAAAGACCCTGTAACGAATCAAAAACAATCTGGACGTTGCTGGATGTTTGCTGCTTTGAACACTTTCCGTCATAAATTT 960
S H A A N L P E F S L D L T K D P V T N Q K Q S G R C W M F A A L N T F R H K F 81
ATTAATGAATTTAAAACAGAAGATTTTGAATTTTCACAAGCTTATACTTTCTTCTGGGATAAATATGAAAAATCAAACTGGTTTATGGAACAAATTATAGGAGTAGTTGCGATGGACGAC 1080
I N E T K T E D Z E T S Q A Z T F F W D K Z E K S N W F M E Q I I G D V A M D D 121
CGTCGTTTGAAATTCCTCTTGCAAACTCCACAACAAGATGGTGGTCAATGGGATATGATGGTAGCCATTTTTGACAAATATGGAATTGTTCCAAAAGCTGTTTATCCTGAATCACAAGCT 1200
R R L K F L L Q T P Q Q D G G Q W D M M V A I F D K Z G I V P K A V Z P E S Q A 161
TCAAGTAGCTCACGCGAATTGAATCAATACTTGAACAAATTGCTCCGACAAGATGCTGAAATCTTACGTTATACAATTGAGCAAGACGGTGATGTTCAAGCGGTCAAAGAAGAACTTTTA 1320
S S S S R E L N Q I L N K L L R Q D A E I L R Y T I E Q D G D V Q A V K E E L L 201
CAAGAAGTTTTTAATTTCCTTGCTGTAACTCTAGGTTTGCCACCACAAAATTTTGAATTTGCTTTCCGCAACAAAGATAATGAATACAAAAAATTTGTTGGAACGCCAAAAGAATTCTAC 1440
Q E V F N F L A V T L G L P P Q N F E F A F R N K D N E Y K K F V G T P K E F Y 241
AACGAATATGTTGGGATTGATTTGAACAATTATGTTTCGGTCATTAATGCTCCAACTGCTGATAAACCTATAAACAAAAGCTATACCGTTGAATTTCTTGGTAATGTAGTCGGTGGTAAA 1560
N E Y V G I D L N N Y V S V I N A P T A D K P Y N K S Y T V E F L G N V V G G K 281
GAAGTCAAACACTTGAACGTTGAGATGGACCGTTTCAAAAAATTGGCTATTGCCCAAATGCGGGCGAAACTGTCTGTTTGGGTGACGTTGGTCAAGAATCAAGAATCAAACCGTTCAGCA 1680
E V K H L N V E M D R F K K L A I A Q M Q A G E T V W F G C D V G Q E S N R S A 321
GGACTTTTGACAATGGATTCTTATGATTTTAAATCTTCATTGGATATTGAATTCACACAAAGTAAGGCTGGACGTCTTGACTATGGCGAATCACTGATGACTCATGCCATGGTTTTAGCG 1800
G L L T M D S Z D F K S S L D I E F T Q S K A G R L D Y G E S L N T H A M V L A 361 GGTGTTGATTTAGATGCTGACGGAAATTCAACTAAATGGAAAGTTGAAAATTCTTGGGGTAAAGATGCCGGTCAAAAAGGATATTTCGTTGCTTCTGATGAATGGATGGATGAATATACT 1920
G V D L D A D G N S T K W K V E N S W G K D A G Q K G Y F V A S D E W M D E Y T 401
TATCAAATTGTTGTCCGCAAAGACCTTTAAGCGAAGAAGAATTAGCTGCTTATGAAGCAAAACCTCAAGTTCTGCTTCCAATGGGATCCAATGGGAGCCTTGGCTTAATTTGTAAATTGA 2040
Y Q I V V R K D L L S E E E L A A Y E A K P Q V L L P W D P M G A L A * 436
AACATTTAACTTTTGTTAAATGTTTTTTTATTGACTTAAAGTTCACTTCAAGTGTTAAAATAAAAGAATGAATATAAAAAAGGCCGCCGACTTATCAGGGATAAAAACAGATAATATCAG 2160
ATATTATGAAAGAATTGGGCTAATTCCTAAAATTGCACGGACAGAGTCTGGAATACGAAATTTTTCAGAAGCGAATATTAGAACATTAAAATTCGTCAAACATATGAGAGATGCAGGAGT 2280
GCAAGTAGAACCCTTGACACGTTATATGGTATTGGTAACTGAAGGAAATCCTAATACTAAAGAATAAAGAATTGAAATTCTGAAGAGTCAAGTTGAACAATTGAGAACAGAAATTATTGA 2400
AAAACAATCTGCTTTAGATTATTTAACATTCAAAATTGAAAATTATGATGAAGTCATGCTTCCAAGCGAAATGAATTTGAATCAAAGTTCAACAGAAACAATAAAAATTTGAAGAGGATA 2520
AGGATAAATGGAACTTCGATTATTAAAGTATTTTTGGACAGTTGCCACTGCTGGGACGGTATCCAAAGCTGCTGACAGTTATATATTACACAGCCAACATTATCTAGACAAATTAAAGAA 2640
CTTGAACGAGAATTAGATACTCAGCTTTTTATGCGTATGGGAAAAAGCTTATCTTGACTGAAGATGGTCAATTCTTAAAATCAAAGCTGAAGAGATTTTACAGCTG 2748
LISTE DES SEQUENCES : SEQ. ID. N01 (Suite)
LIST OF SEQUENCES: SEQ. ID. N01 CAGCTGAACAACTGGTAATTGATTATTCAGAGAAAAGTGTGATAGTTCAAAAAGAAAAATTAATTGCAAAAAATACTGACGAAAATTTGAAGCTAATTTTTACTGATGGAGTGCAACAAA 120
AEQLVIDISEKSVIVQKEKLI AKNTDNNLKLIFTDGVQQ
ORF #
AAGAGATTAACCAGTTTATCAGTAAGAGTCAAGCTTTTGTTGCTGGACTTATGCATGATATTGGTGGGGTTTATCCAAATCATCAGCGAGTAGAAAAAGCAGAATTATTTGGTATAGAAT 240
KEINQFISKSQAFVAGLNHDI GGVIPNEQRVEKALEFGIE
TACTGACAGAAGAGCGTGAATTTCCTTTGATTATTCATCAAAAACTTTCTAAATATCTGGCGCGTGAGCATTTTAAAATTACTGACGAAAATATATTGTCAGCGATTGAGTGCCACACAA 480
TLKENFTELDLIVFLADKISW DGGDNAPFKEGLLTALSVN
TGCAAAGTGCAGCACTTTATTATATAGACTTCATCATCAATGATGGCTTGAAAGTTGCGCACCCGTGGCTTTTAGAAGCAAAGAAAGATTTAGAAAATCAGCTTTCCTAGCTGATTTTTT 600
LQSAALYYIDFIINDGLKVAH PWLLEAKKDLENQLS *
-35
TGATAATTTAGATTATAATAGAAGAATGTAAAAATAATAGAATATCATTAATCAAAATCGATAATGATTATTTTTATCGAAACTTTTGTCAGAAGTTTCGATTTATTGGGAGGTATTATG 720
RES M 1
-10 ORF1 #
ACAGTAACATCAGATTTCACACAAAAACTCTACGAAAATTTTGCTGAAAACACAAAATTGCGTGCGGTGGAAAATGCCGTGACTAAAAATGGTTTGCTTTCATCACTCGAAGTGCGTGGT 840
TVTSDFTQELTENFAENTKLR AVENAVTENGLLSSLSVRG 41
TCACATGCAGCGAATTTGCCTGAGTTTTCACTTGACTTGACAAAAGACCCTGTAACGAATCAAAAACAATCTGGACGTTGCTGGATGTTTGCTGCTTTGAACACTTTCCGTCATAAATTT 960
SHAANLPEFSLDLTKDPVTNQ KQSGRCWMFAALNTFRHKF 81
ATTAATGAATTTAAAACAGAAGATTTTGAATTTTCACAAGCTTATACTTTCTTCTGGGATAAATATGAAAAATCAAACTGGTTTATGGAACAAATTATAGGAGTAGTTGCGATGGACGAC 1080
INETKTEDZETSQAZTFFWDK ZEKSNWFMEQIIGDVAMDD 121
CGTCGTTTGAAATTCCTCTTGCAAACTCCACAACAAGATGGTGGTCAATGGGATATGATGGTAGCCATTTTTGACAAATATGGAATTGTTCCAAAAGCTGTTTATCCTGAATCACAAGCT 1200
RRLKFLLQTPQQDGGQWDMMV AIFDKZGIVPKAVZPESQA 161
TCAAGTAGCTCACGCGAATTGAATCAATACTTGAACAAATTGCTCCGACAAGATGCTGAAATCTTACGTTATACAATTGAGCAAGACGGTGATGTTCAAGCGGTCAAAGAAGAACTTTTA 1320
SSSSRELNQILNKLLRQDAEI LRYTIEQDGDVQAVKEELL 201
CAAGAAGTTTTTAATTTCCTTGCTGTAACTCTAGGTTTGCCACCACAAAATTTTGAATTTGCTTTCCGCAACAAAGATAATGAATACAAAAAATTTGTTGGAACGCCAAAAGAATTCTAC 1440
QEVFNFLAVTLGLPPQNFEFA FRNKDNEYKKFVGTPKEFY 241
AACGAATATGTTGGGATTGATTTGAACAATTATGTTTCGGTCATTAATGCTCCAACTGCTGATAAACCTATAAACAAAAGCTATACCGTTGAATTTCTTGGTAATGTAGTCGGTGGTAAA 1560
NEYVGIDLNNYVSVINAPTAD KPYNKSYTVEFLGNVVGGK 281
GAAGTCAAACACTTGAACGTTGAGATGGACCGTTTCAAAAAATTGGCTATTGCCCAAATGCGGGCGAAACTGTCTGTTTGGGTGACGTTGGTCAAGAATCAAGAATCAAACCGTTCAGCA 1680
EVKHLNVEMDRFKKLAIAQMQ AGETVWFGCDVGQESNRSA 321
GGACTTTTGACAATGGATTCTTATGATTTTAAATCTTCATTGGATATTGAATTCACACAAAGTAAGGCTGGACGTCTTGACTATGGCGAATCACTGATGACTCATGCCATGGTTTTAGCG 1800
GLLTMDSZDFKSSLDIEFTQS KAGRLDYGESLNTHAMVLA 361 GGTGTTGATTTAGATGCTGACGGAAATTCAACTAAATGGAAAGTTGAAAATTCTTGGGGTAAAGATGCCGGTCAAAAAGGATATTTCGTTGCTTCTGATGAATGGATGATGA
GVDLDADGNSTKWKVENSWGK DAGQKGYFVASDEWMDEYT 401
TATCAAATTGTTGTCCGCAAAGACCTTTAAGCGAAGAAGAATTAGCTGCTTATGAAGCAAAACCTCAAGTTCTGCTTCCAATGGGATCCAATGGGAGCCTTGGCTTAATTTGTAAATTGA 2040
YQIVVRKDLLSEEELAAYEAK PQVLLPWDPMGALA * 436
AACATTTAACTTTTGTTAAATGTTTTTTTATTGACTTAAAGTTCACTTCAAGTGTTAAAATAAAAGAATGAATATAAAAAAGGCCGCCGACTTATCAGGGATAAAAACAGATAATATCAG 2160
ATATTATGAAAGAATTGGGCTAATTCCTAAAATTGCACGGACAGAGTCTGGAATACGAAATTTTTCAGAAGCGAATATTAGAACATTAAAATTCGTCAAACATATGAGAGATGCAGGAGT 2280
GCAAGTAGAACCCTTGACACGTTATATGGTATTGGTAACTGAAGGAAATCCTAATACTAAAGAATAAAGAATTGAAATTCTGAAGAGTCAAGTTGAACAATTGAGAACAGAAATTATTGA 2400
AAAACAATCTGCTTTAGATTATTTAACATTCAAAATTGAAAATTATGATGAAGTCATGCTTCCAAGCGAAATGAATTTGAATCAAAGTTCAACAGAAACAATAAAAATTTGAAGAGGATA 2520
AGGATAAATGGAACTTCGATTATTAAAGTATTTTTGGACAGTTGCCACTGCTGGGACGGTATCCAAAGCTGCTGACAGTTATATATTACACAGCCAACATTATCTAGACAAATTAAAGAA 2640
CTTGAACGAGAATTAGATACTCAGCTTTTTATGCGTATGGGAAAAAGCTTATCTTGACTGAAGATGGTCAATTCTTAAAATCAAAGCTGAAGAGATTTTACAGCTG 2748
LIST OF SEQUENCES: SEQ. ID. N01 (Continued)

Claims (14)

REVENDICATIONS 1) Fragment d'acide nucléique, caractérisé en ce qu'il comprend une séquence codant pour l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis, ou pour un fragment de celle-ci. 1) Nucleic acid fragment, characterized in that it comprises a sequence coding for the PepC aminopeptidase from Lactococcus lactis, or for a fragment thereof. 2) Fragment d'acide nucléique selon la Revendication 1, caractérisé en ce qu'il comprend une séquence représentée dans la liste des séquences en annexe sous le n SEQ. ID N 1, ou un fragment de celle-ci. 2) Nucleic acid fragment according to Claim 1, characterized in that it comprises a sequence represented in the list of sequences in the annex under the n SEQ. ID N 1, or a fragment thereof. 3) Fragment d'acide nucléique de plus de 10 pb, caractérisé en ce qu'il s'hybride spécifiquement avec une séquence selon l'une quelconque des Revendications 1 ou 2, ou avec son complémentaire. 3) Nucleic acid fragment of more than 10 bp, characterized in that it specifically hybridizes with a sequence according to any one of Claims 1 or 2, or with its complement. 4) Vecteur recombinant caractérisé en ce qu'il comprend au moins un fragment d'acide nucléique selon l'une quelconque des Revendications 1 à 3. 4) Recombinant vector characterized in that it comprises at least one nucleic acid fragment according to any one of Claims 1 to 3. 5) Vecteur recombinant selon la Revendication 4, caractérisé en ce qu'il est constitué par le plasmide pTIL24 déposé le 12 août 1992, sous le numéro I-1258, auprès de la C.N.C.M..  5) Recombinant vector according to Claim 4, characterized in that it consists of the plasmid pTIL24 deposited on August 12, 1992, under the number I-1258, with the C.N.C.M .. 6) Vecteur recombinant selon la Revendication 4, caractérisé en ce qu'il comprend en outre des séquences propres à contrôler l'expression du gène de l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis. 6) Recombinant vector according to Claim 4, characterized in that it further comprises sequences suitable for controlling the expression of the gene for the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis. 7) Cellules eucaryotes ou procaryotes transformées, caractérisées en ce qu'elles contiennent au moins un fragment d'acide nucléique selon l'une quelconque des Revendications 1 à 3. 7) Transformed eukaryotic or prokaryotic cells, characterized in that they contain at least one nucleic acid fragment according to any one of Claims 1 to 3. 8) Polypeptide caractérisé en ce qu'il comprend 435 acides aminés, et en que sa séquence est celle de l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis. 8) Polypeptide characterized in that it comprises 435 amino acids, and in that its sequence is that of the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis. 9) Polypeptide selon la Revendication 8, caractérisé en ce que sa séquence est celle de l'aminopeptidase PepC de Lactococcus lactis subsp. 9) Polypeptide according to Claim 8, characterized in that its sequence is that of the aminopeptidase PepC from Lactococcus lactis subsp. ORF1 de la séquence représentée à la liste des séquences, sous le numéro SEQ. ID. Ne 1.ORF1 of the sequence represented in the list of sequences, under the number SEQ. ID. Do 1. cremoris AM2, telle que codée par le cadre de lecture cremoris AM2, as encoded by the reading frame 10) Fragment peptidique caractérisé en ce qu'il représente plus de 5 acides aminés consécutifs de la séquence de l'aminopeptidase PepC selon l'une quelconque des Revendications 8 ou 9. 10) Peptide fragment characterized in that it represents more than 5 consecutive amino acids of the sequence of the aminopeptidase PepC according to any one of Claims 8 or 9. 11) Protéine recombinante, caractérisée en ce qu'elle comprend tout ou partie de la séquence de l'aminopeptidase PepC selon l'une quelconque des 11) Recombinant protein, characterized in that it comprises all or part of the sequence of the PepC aminopeptidase according to any one of Revendication 8 ou 9, éventuellement fusionnée avec une autre séquence polypeptidique.Claim 8 or 9, possibly fused with another polypeptide sequence. 12) Procédé de production d'une protéine recombinante selon la Revendication 11, lequel procédé est caractérisé en ce qu'il comprend une étape au cours de laquelle on procède à la mise en culture de cellules transformées selon la Revendication 7. 12) Method for producing a recombinant protein according to Claim 11, which method is characterized in that it comprises a step during which the cultivation of transformed cells according to Claim 7 is carried out. 13) Utilisation d'une cellule transformée selon la Revendication 7 pour la fabrication d'aliments. 13) Use of a transformed cell according to Claim 7 for the manufacture of food. 14) Utilisation d'une protéine recombinante selon la Revendication 11 pour la fabrication d'aliments.  14) Use of a recombinant protein according to Claim 11 for the manufacture of food.
FR9210006A 1992-08-13 1992-08-13 Cloning of the structural gene for a lactococcus lactis aminopeptiddase, production and uses of said aminopeptidase. Expired - Fee Related FR2694766B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9210006A FR2694766B1 (en) 1992-08-13 1992-08-13 Cloning of the structural gene for a lactococcus lactis aminopeptiddase, production and uses of said aminopeptidase.

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9210006A FR2694766B1 (en) 1992-08-13 1992-08-13 Cloning of the structural gene for a lactococcus lactis aminopeptiddase, production and uses of said aminopeptidase.

Publications (2)

Publication Number Publication Date
FR2694766A1 true FR2694766A1 (en) 1994-02-18
FR2694766B1 FR2694766B1 (en) 1994-12-23

Family

ID=9432846

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FR9210006A Expired - Fee Related FR2694766B1 (en) 1992-08-13 1992-08-13 Cloning of the structural gene for a lactococcus lactis aminopeptiddase, production and uses of said aminopeptidase.

Country Status (1)

Country Link
FR (1) FR2694766B1 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001030172A1 (en) * 1999-10-28 2001-05-03 Dsm N.V. Kluyveromyces lactis as attenuated starter
WO2005056801A1 (en) * 2003-12-15 2005-06-23 Genesis Research And Development Corporation Limited Polynucleotides and polypeptides isolated from lactobacillus rhamnosus hn001 materials incorporating them and methods for using them

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0415470A2 (en) * 1989-08-02 1991-03-06 Campina Melkunie B.V. Aminopeptidase

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0415470A2 (en) * 1989-08-02 1991-03-06 Campina Melkunie B.V. Aminopeptidase

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY vol. 55, no. 9, Septembre 1989, pages 2308 - 2314 E. NEVIANI ET AL 'Purification and characterization of an aminopeptidase from Lactococcus lactis subs. cremoris AM2' *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001030172A1 (en) * 1999-10-28 2001-05-03 Dsm N.V. Kluyveromyces lactis as attenuated starter
US6902749B1 (en) 1999-10-28 2005-06-07 Dsm Ip Assets B.V. Kluyveromyces lactis as attenuated starter
WO2005056801A1 (en) * 2003-12-15 2005-06-23 Genesis Research And Development Corporation Limited Polynucleotides and polypeptides isolated from lactobacillus rhamnosus hn001 materials incorporating them and methods for using them

Also Published As

Publication number Publication date
FR2694766B1 (en) 1994-12-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Mohanty et al. Bovine chymosin: Production by rDNA technology and application in cheese manufacture
Nardi et al. Cloning and DNA sequence analysis of an X-prolyl dipeptidyl aminopeptidase gene from Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 763
Chapot-Chartier et al. Cloning and sequencing of pepC, a cysteine aminopeptidase gene from Lactococcus lactis subsp. cremoris AM2
Monnet et al. Biochemical and genetic characterization of PepF, an oligopeptidase from Lactococcus lactis.
Mierau et al. Cloning and sequencing of the gene for a lactococcal endopeptidase, an enzyme with sequence similarity to mammalian enkephalinase
JPH08501685A (en) Production of phytate-degrading enzymes in Trichoderma
Chavagnat et al. Purification, characterization, gene cloning, sequencing, and overexpression of aminopeptidase N from Streptococcus thermophilus A
Bruinenberg et al. Evidence for a large dispensable segment in the subtilisin-like catalytic domain of the Lactococcus lactis cell-envelope proteinas
Klein et al. Cloning and nucleotide sequence analysis of the Lactobacillus delbrueckii ssp. lactis DSM7290 cysteine aminopeptidase gene pepC
AU706127B2 (en) Process for the lysis of a culture of lactic acid bacteria by means of a lysin, and uses of the resulting lysed culture
FR2694766A1 (en) New nucleic acid encoding aminopeptidase PepC of Lactococcus lactis - useful in cheese mfr., also related vectors, transformants, polypeptide(s) etc.
JPH05500456A (en) Improved protein processing
JPH11500604A (en) Production of modified herring
FR2739629A1 (en) USE OF A DRY-DEPENDENT SECRETION SYSTEM FOR SECRETING PROTEIN NORMALLY SECRETED BY A DRY-INDEPENDENT SECRETION SYSTEM, BACTERIA CONTAINING THEM AND THEIR USE
Bruinenberg et al. Prevention of C-terminal autoprocessing of Lactococcus lactis SK11 cell-envelope proteinase by engineering of an essential surface loop
Soeryapranata et al. Cloning and characterization of debittering peptidases, PepE, PepO, PepO2, PepO3, and PepN, of Lactobacillus helveticus WSU19
EP0522203A1 (en) Protein from lactic acid bacteria
AU638042B2 (en) Modified proteases and their use in foodstuffs
WO2021176039A1 (en) Gram-positive bacteria of the species lactococcus lactis or streptococcus thermophilus having a very low surface proteolysis, processes for obtaining them and uses thereof
EP0633316A1 (en) Lys-aminopeptidase PepN from lactobacillus delbruckii ssp. Lactis, nucleic acids coding for it, and its use in fermentation processes
EP1222250B1 (en) Mutant lactic bacteria with a capacity for overexpressing at least one peptidase
Izawa et al. Cloning and nucleotide sequencing of the aminopeptidase gene from Aeromonas caviae T-64
Roller et al. Food enzymes
Magboul et al. PepN-like aminopeptidase from Lactohacillus curvatus DPC2024: purification and characterization
JP3516318B2 (en) Novel endopeptidase

Legal Events

Date Code Title Description
ST Notification of lapse