Jediným akcionářem ČEPS, a.s. je stát Česká republika. Výkon akcionářských práv provádí z pověření státu Ministerstvo průmyslu a obchodu.
Akcionářská struktura k 27. 2. 2012:
100 % Ministerstvo průmyslu a obchodu
| Druh akcie: | akcie kmenová |
| Forma: | cenný papír na jméno |
| Podoba: | listinná |
| Počet kusů: | 178 557 333 |
| Celková jmenovitá hodnota: | 10 534 882 647 Kč |
| Jmenovitá hodnota akcie: | 59 Kč |
